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个人信息
个人简介
工作经历2018年-至今，新威尼斯v0008，新威尼斯v0008，副教授 教育经历2008年-2013年，新威尼斯v0008，系统生物学研究中心，博士 2011年-2012年，芬兰奥卢大学，奥卢生物中心生物化学和分子医学系，国家公派留学 2004年-2008年，新威尼斯v0008，数学科学学院，本科 研究领域
生物信息学、系统生物学、医学信息学 基本信息
 职称：副教授 院部/部门：苏州医学院基础医学院 学历：博士 学位： 毕业学校：新威尼斯v0008 毕业专业： 联系方式
通讯地址： 邮政编码： 电子邮箱：wyyan@suda.edu.cn 联系电话： 传真号码： 办公地点：新威尼斯v0008独墅湖校区403-B304 科学研究
目前主要从事基于生物医学多模态数据的多尺度生物网络模型的构建、分析与应用，尝试从分子、细胞、表型等刻画并预测癌症（特别是胃癌）的发生发展，为理解癌症的演变机制、生物标志物的识别、癌症的诊疗等提供理论指导。 承担科研项目1、国家自然科学基金青年基金，基于氨基酸接触能网络的蛋白质结合位点分析，19 万，2017-2019，主持 2、江苏省重点研发计划，基于人工智能算法的胃癌早期诊断及发展预警模型的构建及应用，200万，2020-2023，项目骨干 科研团队
论文
2023年Wenying Yan; Yuqi Chen; Guang Hu; Tongguo Shi; Xingyi Liu; Juntao Li; Linqing Sun; Fuliang Qian; Weichang Chen. Journal of Translational Medicine, 2023, 21(1) (SCI大类二区，第一作者) Yuqi Chen; Wenying Yan; Kexi Yang; Yiting Qian; Yanjun Chen; Ruoqin Wang; Jinghan Zhu; Yuxin He; Hongya Wu; Guangbo Zhang; Tongguo Shi; Weichang Chen. Journal of Experimental & Clinical Cancer Research, 2023, 42(1) (SCI大类一区，并列第一作者) Xingyi Liu; Bin Yang; Xinpeng Huang; Wenying Yan; Yujuan Zhang; Guang Hu. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2023, Online ahead of print (SCI大类三区，并列通讯作者) A comprehensive review on knowledge graphs for complex diseases. Yang, Yang; Lu, Yuwei; Yan, Wenying. Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(1) (SCI大类二区，通讯作者) A protein co-conservation network model characterizes mutation effects on SARS-CoV-2 spike protein. Lianjie Zeng; Yitan Lu; Wenying Yan; Yang Yang International Journal of Molecular Sciences, 2023, 24(4): 3255 (SCI大类二区，并列通讯作者) DeepTP: A deep learning model for thermophilic protein prediction. Jianjun Zhao; Wenying Yan; Yang Yang International Journal of Molecular Sciences, 2023, 24(3): 2217 (SCI大类二区，并列通讯作者) 2022年Structural Biology Meets Biomolecular Networks: The Post-AlphaFold Era Wenying Yan; Guang Hu Current Bioinformatics, 2022, 17(6). (SCI大四区，第一作者) 2021年Fan Wang; Shuqing Han; Ji Yang; Wenying Yan; Guang Hu Cells, 2021, 10(2): 402. (SCI大类二区，并列通讯作者) Ji Yang; Hongchun Li; Fan Wang; Fei Xiao; Wenying Yan; Guang Hu ACS Chemical Neuroscience, 2021, 12(5): 917-929. (SCI大类二区，并列通讯作者) Deciphering the in vivo Dynamic Proteomics of Mesenchymal Stem Cells in Critical Limb Ischemia Yipeng Du; Xiaoting Li; Wenying Yan; Zhaohua Zeng; Dunzheng Han; Hong Ouyang; Xiudi Pan; Bihui Luo; Bohua Zhou; Qiang Fu; Dongfeng Lu; Zheng Huang; Zhiliang Li Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021, 9 (SCI大类二区，并列第一作者) 2020年Yuqi Chen; Huang Feng; Yanlin Wu; Ruoqin Wang; Zhaoji Li; Jiajia Chen; Wenying Yan; Weichang Chen Clinical and Translational Medicine, 2020, 10(6). (SCI大类一区，并列通讯作者) Wenying Yan; Xingyi Liu; Yibo Wang; Shuqing Han; Fan Wang; Xin Liu; Fei Xiao; Guang Hu Frontiers in Pharmacology, 2020, 11: 0-534. (SCI大类二区，第一作者) ANCA: A web server for amino acid networks construction and analysis Wenying Yan; Chunjiang Yu; Jiajia Chen; Jianhong Zhou; Bairong Shen Frontiers in Molecular Biosciences, 2020, 7: 582702. (SCI大类二区，第一作者) Understanding the cross-talk between host and virus in poultry from the perspectives of microRNA Xiujun Duan; Lihua Wang; Guobo Sun; Wenying Yan; Yang Yang Poultry Science, 2020, 99(4): 1838-1846. (SCI大类二区，并列通讯作者) 2018年Wenying Yan; Guang Hu; Zhongjie Liang; Jianhong Zhou; Yang Yang; Jiajia Chen; Bairong Shen Journal of Chemical Information and Modeling, 2018, 58(9): 2024-2032. (SCI大类二区，第一作者， Recent Advances on the Network Models in Target-based Drug Discovery Wenying Yan; Daqing Zhang; Chen Shen; Zhongjie Liang; Guang Hu Current Topics in Medicinal Chemistry, 2018, 18(13): 1031-1043.(SCI大类四区，第一作者) 2016年Network analysis of protein structures: the comparison of three topologies Wenying Yan; Guang Hu; Bairong Shen Current Bioinformatics, 2016, 11(4): 480-489. (SCI大类三区，第一作者) Comparison of prognostic microrna biomarkers in blood and tissues for gastric cancer Wenying Yan; Laijun Qian; Jiajia Chen; Weichang Chen; Bairong Shen Journal of Cancer, 2016, 7(1): 95-106. (SCI大类三区，第一作者) 2014年Amino acid contact energy networks impact protein structure and evolution Wenying Yan; Maomin Sun; Guang Hu; Jianhong Zhou; Wenyu Zhang; Jiajia Chen; Biao Chen; Bairong Shen Journal of Theoretical Biology, 2014, 355: 95-104. (SCI大类三区，第一作者) The construction of an amino acid network for understanding protein structure and function Wenying Yan; Jianhong Zhou; Maomin Sun; Jiajia Chen; Guang Hu; Bairong Shen Amino Acids, 2014, 46(6): 1419-1439. (SCI大类三区，第一作者) SVR_CAF: an integrated score function for detecting native protein structures among decoys Jianhong Zhou; Wenying Yan; Guang Hu; Bairong Shen Proteins, 2014, 82(4): 556-564. (SCI大类三区，并列第一作者) Amino acid network for the discrimination of native protein structures from decoys Jianhong Zhou; Wenying Yan; Guang Hu; Bairong Shen Current Protein and Peptide Science, 2014, 15(6): 522-528. (SCI大类三区，并列第一作者) 专著沈百荣主编，严文颖、张文宇、钱福良、 林宇鑫副主编，《深度测序数据的生物信息学分析及实例》，2017，科学出版社，ISBN：9787030545800 专利2、杨洋; 朱冠臣; 丁雪松; 吕强; 严文颖; 朱斐。一种基于序列预测蛋白质变性温度的系统及其方法。授权日期：2023-3-31。专利号：ZL201910719819.6 1、严文颖; 沈百荣; 杨洋。基于结构网络模型的蛋白质功能位点预测方法。授权日期：2021-3-30。专利号：ZL201810643576.8 荣誉奖励
开授课程
本科生1、生物信息学算法，2019年至今 2、生物信息学导论，2021年至今 3、Biopython，2019年 研究生1、医学生物信息学，2022年至今 2、R语言基础，2019年 3、Python/Biopython编程，2019年 招生信息
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